Na dwóch piętrach kamienicy urządzono wystawę wnętrz (Mieszczański dom), których wystrój pozwala na odtworzenie realiów życia codziennego krakowskiego mieszczaństwa na przestrzeni kilku stuleci.

Na pierwszym piętrze można zobaczyć m.in. gabinet bogatego mieszczanina z XVII w. ze stiukową dekoracją autorstwa Baltazara Fontany oraz ozdobną sypialnię z rokokowymi malowidłami w pastelowych kolorach i meblami zdobionymi dekoracją kwiatową. Interesującym pomieszczeniem jest „pokój kolekcjonera” ze zbiorem rozmaitych dzieł sztuki – swoistym mikromuzeum w mieszczańskim domu.

Na drugim piętrze pokazano mieszkanie rodziny z końca XIX wieku. Jest tu „pokój babci – przytulny, nieco staroświecki i zagracony mnóstwem drobiazgów, jest „pokój panienki” – urządzony skromnie i bezpretensjonalnie prostymi sprzętami, bez nadmiernej ilości ozdób. Ośrodkiem życia mieszczańskiej rodziny jest jadalnia ze stołem pośrodku, wiszącą nad nim lampą naftową i ustawionymi nieopodal kredensem z rozmaitymi naczyniami, a także ze stolikiem na błyszczący samowar. O pozycji gospodarzy domu świadczył (i świadczy nadal) salon, w którym królują fortepian i kanapa. Salon zdobią obrazy i kilimy, a także serwantka z mnóstwem drobiazgów. Na koniec można zajrzeć do „sypialni państwa”, urządzonej garniturem mebli, w którym najważniejszą rolę odgrywają małżeńskie łoża. Zaś dwa gołąbki ze złoconej ramy lustra przypominają o trwałości małżeńskiego związku. Aury autentyczności, a także domowego ciepła, dodaje dzisiejszej Kamienicy Hipolitów obecność jej wyjątkowego mieszkańca – Hipolita, kota muzealnika.